كشفت تحقيقات النيابة العامة فى قضية تنظيم "أجناد مصر" أسرار وكواليس العديد من أحداث التفجيرات الإرهابية، التى روعت المجتمع منذ عزل الرئيس الأسبق محمد مرسى عام 2013، واستمعت خلالها إلى مائة وستة وعشرين شاهدا، بخلاف خبراء الطب الشرعى، والأدلة الجنائية، والجهات الأمنية، وأجرت النيابة العامة المعاينة اللازمة للأماكن التى شهدت الأحداث وقت وقوعها، كما أجرت المعاينات التصويرية اللازمة بعد أن اعترف ثمانية من الإرهابيين بارتكاب جرائم الإرهاب والقتل العمد والشروع فيه.

وأوضحت التحقيقات أن تنظيم أجناد مصر الإرهابى وضع مخطط تولت عناصره تنفيذه، لاستهداف مؤسسات الدولة، والمنشآت الأمنية، وتخريب الأملاك العامة، عن طريق تسليحهم وتصنيع المتفجرات وحيازتها.

وفجرت التحقيقات مفاجأة إذ تبين أن عناصر تنظيم أجناد مصر عكفوا على تصنيع غواصة صغيرة لاستخدامها فى العمليات، وحيازة طائرة لاسلكية، وإنسان آلى، لتحميلهم بالمتفجرات واستخدامهم فى استهداف السفن العابرة بالمجرى الملاحى لقناة السويس، والمنشآت العامة والعسكرية.