أودع حرس محكمة معهد الأمناء بطرة الدكتور محمد بديع، المرشد العام لجماعة الإخوان، وقيادات جماعة الإخوان قفص الاتهام، تمهيدًا لبدء محاكمتهم فى أحداث البحر الأعظم.

وحيا بديع أعضاء هيئة الدفاع قبل بدء محاكمته قائلا لهم "أعانكم الله, والملائكة تحارب معكم", وقال أيضا "الشيخ حازم بيسلم عليكم"، فى إشارة إلى الشيخ حازم صلاح أبو إسماعيل.

ويحاكم إلى جانب بديع كل من محمد البلتاجى وعصام العريان، وعاصم عبد الماجد "هارب"، وصفوت حجازى، وعزت صبرى حسن، وأنور على، والحسينى عنتر محروس، وهشام إبراهيم كامل، وجمال فتحى يوسف، وأحمد ضاحى محمد، وعزب مصطفى مرسى، وباسم عودة، وأبو الدهب حسن محمد، ومحمد على طلحة.

وكانت النيابة أسندت إلى المتهمين قيامهم بارتكاب جرائم عديدة منها التجمهر والإرهاب والشروع فى القتل واستعراض القوة، وتشكيل عصابة مسلحة لمهاجمة المواطنين ومقاومة السلطات، وحيازة أسلحة نارية وذخائر غير مرخصة، فضلا عن الانضمام إلى جماعة إرهابية.